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The Selaginella Genome Identifies Genetic Changes Associated with the Evolution of Vascular Plants

Banks, Jo ; Nishiyama, Tomoaki ; Hasebe, Mitsuyasu ; Bowman, John ; Gribskov, Michael ; Depamphilis, Claude ; Albert, Victor ; Aono, Naoki ; Aoyama, Tsuyoshi ; Ambrose, Barbara ; Ashton, Neil ; Axtell, Michael ; Barker, Elizabeth ; Barker, Michael

Science, May 20, 2011, Vol.332(6032), pp.960-963 [Revue évaluée par les pairs]

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Evolution of an Expanded Sex-Determining Locus in Volvox

Ferris, Patrick ; De Hoff, Peter ; Douglass, Stephen ; Casero, David ; Prochnik, Simon ; Geng, Sa ; Rai, Rhitu ; Grimwood, Jane ; Schmutz, Jeremy ; Nishii, Ichiro ; Hamaji, Takashi ; Nozaki, Hisayoshi ; Pellegrini, Matteo ; Umen, James

Science, Apr 16, 2010, Vol.328(5976), pp.351-354 [Revue évaluée par les pairs]

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Adaptive Evolution of Pelvic Reduction in Sticklebacks by Recurrent Deletion of a Pitx1 Enhancer

Chan, Yingguang ; Marks, Melissa ; Jones, Felicity ; Shapiro, Michael ; Brady, Shannon ; Southwick, Audrey ; Absher, Devin ; Grimwood, Jane ; Schmutz, Jeremy ; Myers, Richard ; Petrov, Dmitri ; Jónsson, Bjarni ; Schluter, Dolph ; Bell, Michael

Science, Jan 15, 2010, Vol.327(5963), pp.302-305 [Revue évaluée par les pairs]

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Complete HOX cluster characterization of the coelacanth provides further evidence for slow evolution of its genome

Amemiya, Chris ; Powers, Thomas ; Prohaska, Sonja ; Grimwood, Jane ; Schmutz, Jeremy ; Dickson, Mark ; Miyake, Tsutomu ; Schoenborn, Michael ; Myers, Richard ; Ruddle, Francis ; Stadler, Peter

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Feb 23, 2010, Vol.107(8), p.3622 [Revue évaluée par les pairs]

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Green Evolution and Dynamic Adaptations Revealed by Genomes of the Marine Picoeukaryotes Micromonas

Worden, Alexandra ; Mock, Thomas ; Simmons, Melinda ; Aerts, Andrea ; Allen, Andrew ; Cuvelier, Marie ; Derelle, Evelyne ; Everett, Meredith ; Foulon, Elodie ; Grimwood, Jane ; Gundlach, Heidrun ; Henrissat, Bernard ; Napoli, Carolyn ; Mcdonald, Sarah

Science, Apr 10, 2009, Vol.324(5924), pp.268-272 [Revue évaluée par les pairs]

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Genomic Analysis of Organismal Complexity in the Multicellular Green Alga Volvox carteri

Prochnik, Simon ; Umen, James ; Nedelcu, Aurora ; Hallmann, Armin ; Miller, Stephen ; Nishii, Ichiro ; Ferris, Patrick ; Kuo, Alan ; Mitros, Therese ; Fritz-Laylin, Lillian ; Hellsten, Uffe ; Chapman, Jarrod ; Simakov, Oleg ; Rensing, Stefan ; Terry, Astrid ; Pangilinan, Jasmyn ; Kapitonov, Vladimir ; Jurka, Jerzy ; Salamov, Asaf ; Shapiro, Harris ; Schmutz, Jeremy ; Grimwood, Jane ; Lindquist, Erika ; Lucas, Susan ; Grigoriev, Igor ; Schmitt, Rudiger ; Kirk, David ; Rokhsar, Daniel ; Prochnik, Simon (correspondence author)

Science (Washington), July 9, 2010, Vol.328(5988), pp.223-226 [Revue évaluée par les pairs]

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The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions

Merchant, Sabeeha ; Grigoriev, Igor ; Rokhsar, Daniel ; Grossman, Arthur

Science, Oct 12, 2007, Vol.318(5848), pp.245-250 [Revue évaluée par les pairs]

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Quality assessment of the human genome sequence

Schmutz, Jeremy ; Wheeler, Jeremy ; Grimwood, Jane ; Dickson, Mark

Nature, May 27, 2004, Vol.429(6990), pp.365-8 [Revue évaluée par les pairs]

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Six is seventh

Grimwood, Jane ; Schmutz, Jeremy

Nature, Oct 23, 2003, Vol.425(6960), pp.775-6 [Revue évaluée par les pairs]

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The Trichoplax genome and the nature of placozoans

Srivastava, Mansi ; Begovic, Emina ; Chapman, Jarrod ; Putnam, Nicholas ; Hellsten, Uffe ; Kawashima, Takeshi ; Kuo, Alan ; Mitros, Therese ; Salamov, Asaf ; Carpenter, Meredith ; Signorovitch, Ana ; Moreno, Maria ; Kamm, Kai ; Grimwood, Jane ; Schmutz, Jeremy ; Shapiro, Harris ; Grigoriev, Igor ; Buss, Leo ; Schierwater, Bernd ; Srivastava, Mansi (correspondence author)

Nature, 21 Aug. 2008, Vol.454(7207), pp.955-960 [Revue évaluée par les pairs]

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Transposable Elements versus the Fungal Genome: Impact on Whole-Genome Architecture and Transcriptional Profiles

Raúl Castanera ; Leticia López-Varas ; Alessandra Borgognone ; Kurt Labutti ; Alla Lapidus ; Jeremy Schmutz ; Jane Grimwood ; Gúmer Pérez ; Antonio G Pisabarro ; Igor V Grigoriev ; Jason E Stajich ; Lucía Ramírez

PLoS Genetics, 01 June 2016, Vol.12(6), p.e1006108 [Revue évaluée par les pairs]

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Preferential retention of genes from one parental genome after polyploidy illustrates the nature and scope of the genomic conflicts induced by hybridization

Marianne Emery ; M Madeline S Willis ; Yue Hao ; Kerrie Barry ; Khouanchy Oakgrove ; Yi Peng ; Jeremy Schmutz ; Eric Lyons ; J Chris Pires ; Patrick P Edger ; Gavin C Conant

PLoS Genetics, 01 March 2018, Vol.14(3), p.e1007267 [Revue évaluée par les pairs]

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Combating a Global Threat to a Clonal Crop: Banana Black Sigatoka Pathogen Pseudocercospora fijiensis (Synonym Mycosphaerella fijiensis) Genomes Reveal Clues for Disease Control

Rafael E Arango Isaza ; Caucasella Diaz-Trujillo ; Braham Dhillon ; Andrea Aerts ; Jean Carlier ; Charles F Crane ; Tristan V de Jong ; Ineke de Vries ; Robert Dietrich ; Andrew D Farmer ; Claudia Fortes Fereira ; Suzana Garcia ; Mauricio Guzman ; Richard C Hamelin ; Erika A Lindquist ; Rahim Mehrabi ; Olman Quiros ; Jeremy Schmutz ; Harris Shapiro ; Elizabeth Reynolds ; Gabriel Scalliet ; Manoel Souza ; Ioannis Stergiopoulos ; Theo A J Van Der Lee ; Pierre J G M De Wit ; Marie-Françoise Zapater ; Lute-Harm Zwiers ; Igor V Grigoriev ; Stephen B Goodwin ; Gert H J Kema

PLoS Genetics, 01 August 2016, Vol.12(8), p.e1005876 [Revue évaluée par les pairs]

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Finished genome of the fungal wheat pathogen Mycosphaerella graminicola reveals dispensome structure, chromosome plasticity, and stealth pathogenesis

Stephen B Goodwin ; Sarrah Ben M'Barek ; Braham Dhillon ; Alexander H J Wittenberg ; Charles F Crane ; James K Hane ; Andrew J Foster ; Theo A J Van Der Lee ; Jane Grimwood ; Andrea Aerts ; John Antoniw ; Andy Bailey ; Burt Bluhm ; Judith Bowler ; Jim Bristow ; Ate van Der Burgt ; Blondy Canto-Canché ; Alice C L Churchill ; Laura Conde-Ferràez ; Hans J Cools ; Pedro M Coutinho ; Michael Csukai ; Paramvir Dehal ; Pierre De Wit ; Bruno Donzelli ; Henri C van de Geest ; Roeland C H J van Ham ; Kim E Hammond-Kosack ; Bernard Henrissat ; Andrzej Kilian ; Adilson K Kobayashi ; Edda Koopmann ; Yiannis Kourmpetis ; Arnold Kuzniar ; Erika Lindquist ; Vincent Lombard ; Chris Maliepaard ; Natalia Martins ; Rahim Mehrabi ; Jan P H Nap ; Alisa Ponomarenko ; Jason J Rudd ; Asaf Salamov ; Jeremy Schmutz ; Henk J Schouten ; Harris Shapiro ; Ioannis Stergiopoulos ; Stefano F F Torriani ; Hank Tu ; Ronald P de Vries ; Cees Waalwijk ; Sarah B Ware ; Ad Wiebenga ; Lute-Harm Zwiers ; Richard P Oliver ; Igor V Grigoriev ; Gert H J Kema

PLoS Genetics, 01 June 2011, Vol.7(6), p.e1002070 [Revue évaluée par les pairs]

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The DNA sequence and biology of human chromosome 19

Grimwood, Jane ; Gordon, Laurie ; Olsen, Anne ; Terry, Astrid ; Grimwood, Jane (correspondence author)

Nature, 1 Apr. 2004, Vol.428(6982), pp.529-535 [Revue évaluée par les pairs]

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Genome Sequence of the Plant Growth Promoting Endophytic Yeast Rhodotorula graminis WP1

Andrea Efirrincieli ; Robert Eotillar ; Asaf Esalamov ; Jeremy Eschmutz ; Zareen Ekhan ; Regina S. Redman ; Neil David Fleck ; Erika Elindquist ; Igor V. Grigoriev ; Sharon Lafferty Doty

Frontiers in Microbiology, 01 September 2015, Vol.6 [Revue évaluée par les pairs]

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Assembly of the Boechera retrofracta Genome and Evolutionary Analysis of Apomixis-Associated Genes

Sergei Kliver ; Mike Rayko ; Alexey Komissarov ; Evgeny Bakin ; Daria Zhernakova ; Kasavajhala Prasad ; Catherine Rushworth ; R. Baskar ; Dmitry Smetanin ; Jeremy Schmutz ; Daniel S. Rokhsar ; Thomas Mitchell-Olds ; Ueli Grossniklaus ; Vladimir Brukhin

Genes, 01 March 2018, Vol.9(4), p.185 [Revue évaluée par les pairs]

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Population genomics and climate adaptation of a C4 perennial grass, Panicum hallii (Poaceae)

Billie A. Gould ; Juan Diego Palacio-Mejia ; Jerry Jenkins ; Sujan Mamidi ; Kerrie Barry ; Jeremy Schmutz ; Thomas E. Juenger ; David B. Lowry

BMC Genomics, 01 November 2018, Vol.19(1), pp.1-11 [Revue évaluée par les pairs]

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The genome of Nectria haematococca: contribution of supernumerary chromosomes to gene expansion

Jeffrey J Coleman ; Steve D Rounsley ; Marianela Rodriguez-Carres ; Alan Kuo ; Catherine C Wasmann ; Jane Grimwood ; Jeremy Schmutz ; Masatoki Taga ; Gerard J White ; Shiguo Zhou ; David C Schwartz ; Michael Freitag ; Li-Jun Ma ; Etienne G J Danchin ; Bernard Henrissat ; Pedro M Coutinho ; David R Nelson ; Dave Straney ; Carolyn A Napoli ; Bridget M Barker ; Michael Gribskov ; Martijn Rep ; Scott Kroken ; István Molnár ; Christopher Rensing ; John C Kennell ; Jorge Zamora ; Mark L Farman ; Eric U Selker ; Asaf Salamov ; Harris Shapiro ; Jasmyn Pangilinan ; Erika Lindquist ; Casey Lamers ; Igor V Grigoriev ; David M Geiser ; Sarah F Covert ; Esteban Temporini ; Hans D Vanetten

PLoS Genetics, 01 August 2009, Vol.5(8), p.e1000618 [Revue évaluée par les pairs]

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The Aquilegia genome provides insight into adaptive radiation and reveals an extraordinarily polymorphic chromosome with a unique history

Filiault, Danièle ; Ballerini, Evangeline ; Derieg, Nathan ; Schmutz, Jeremy ; Jenkins, Jerry ; Grimwood, Jane ; Hayes, Richard ; Barry, Kerrie ; Kramer, Elena ; Lysak, Martin ; Hodges, Scott ; Hodges, Scott (pacrepositoryorg)

eLife, 2018, Vol.7 [Revue évaluée par les pairs]

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