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Stochastic narrow escape in molecular and cellular biology : analysis and applications

Holcman, David. ; Schuss, Zeev (1937-....)

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2
Stochastic Narrow Escape in Molecular and Cellular Biology
Stochastic Narrow Escape in Molecular and Cellular Biology
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Livre
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Stochastic Narrow Escape in Molecular and Cellular Biology

David Holcman

Springer New York, 2015

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3
Modeling and analysis of randomly cross-linked polymers and application to chromatin organization and dynamics
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Autre
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Modeling and analysis of randomly cross-linked polymers and application to chromatin organization and dynamics

Shukron , Ofir ; Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) ( IBENS ) ; Département de Biologie - ENS Paris ; École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) ; PSL Research University ; David Holcman

https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01835367

HAL CCSD, 2017

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4
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Thèse
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Modélisation et analyse de modèles de polymères aléatoirement réticulé et application à l’organisation et à la dynamique de la chromatine

Shukron, Ofir ; Paris Sciences et Lettres; Holcman, David

2017

Accessible en ligne

5
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Thèse
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Modélisation et analyse de modèles de polymères aléatoirement réticulé et application à l'organisation et à la dynamique de la chromatine

Shukron, Ofir (1981-....) ; Holcman, David ; Carbone, Alessandra ; Victor, Jean-Marc (1959-....) ; Derrida, Bernard ; Vert, Jean-Philippe (1973-....) ; Cosentino Lagomarsino, Marco (1974-....) ; Taddei, Angela ; Université de Recherche Paris Sciences et Lettres - PSL Research University ; École doctorale de Sciences mathématiques de Paris Centre, Paris ; Institut de biologie de l'École normale supérieure, Paris ; École normale supérieure, Paris 1985-....

2017

Accessible en ligne. Accessible en version papier

6
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Article
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The First 100 nm Inside the Pre-synaptic Terminal Where Calcium Diffusion Triggers Vesicular Release.

Guerrier, Claire ; Holcman, David ; Guerrier, Claire (correspondence author) ; Guerrier, Claire (record owner)

Frontiers in synaptic neuroscience, Vol.10, p.23 [Revue évaluée par les pairs]

2018

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7
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Article
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Robust network oscillations during mammalian respiratory rhythm generation driven by synaptic dynamics.

Guerrier, Claire ; Hayes, John A ; Fortin, Gilles ; Holcman, David ; Guerrier, Claire (correspondence author) ; Guerrier, Claire (record owner)

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, August 4, 2015, Vol.112(31), pp.9728-9733 [Revue évaluée par les pairs]

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8
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Stochastic modeling of gene activation and applications to cell regulation

Malherbe, G ; Holcman, David

Journal of Theoretical Biology, 07 January 2011, Vol.271(1), p.51 [Revue évaluée par les pairs]

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9
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Article
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Detection of single photons by toad and mouse rods.

Reingruber, Jürgen ; Pahlberg, Johan ; Woodruff, Michael L ; Sampath, Alapakkam P ; Fain, Gordon L ; Holcman, David ; Reingruber, Jürgen (correspondence author) ; Reingruber, Jürgen (record owner)

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, November 26, 2013, Vol.110(48), pp.19378-19383 [Revue évaluée par les pairs]

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10
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Astroglial networks scale synaptic activity and plasticity

Pannasch, Ulrike ; Vargova, Lydia ; Reingruber, Juergen ; Ezan, Pascal ; Holcman, David ; Giaume, Christian ; Sykova, Eva ; Rouach, Nathalie ; Pannasch, Ulrike (correspondence author)

Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, May 17, 2011, Vol.108(20), pp.8467-8472 [Revue évaluée par les pairs]

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11
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Article
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Astroglial networks scale synaptic activity and plasticity.

Pannasch, Ulrike ; Vargová, Lydia ; Reingruber, Jürgen ; Ezan, Pascal ; Holcman, David ; Giaume, Christian ; Syková, Eva ; Rouach, Nathalie ; Pannasch, Ulrike (correspondence author) ; Pannasch, Ulrike (record owner)

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, May 17, 2011, Vol.108(20), pp.8467-8472 [Revue évaluée par les pairs]

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12
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Heterogeneity of AMPA receptor trafficking and molecular interactions revealed by superresolution analysis of live cell imaging

Hoze, Nathanael ; Nair, Deepak ; Hosy, Eric ; Sieben, Christian ; Manley, Suliana ; Herrmann, Andreas ; Sibarita, Jean-Baptiste ; Choquet, Daniel ; Holcman, David

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Oct 16, 2012, Vol.109(42), p.17052 [Revue évaluée par les pairs]

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13
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Article
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The length of the shortest telomere as the major determinant of the onset of replicative senescence.

Xu, Zhou ; Duc, Khanh Dao ; Holcman, David ; Teixeira, Maria Teresa ; Xu, Zhou (correspondence author) ; Xu, Zhou (record owner)

Genetics, August 2013, Vol.194(4), pp.847-857 [Revue évaluée par les pairs]

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14
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Article
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A mechanism for the polarity formation of chemoreceptors at the growth cone membrane for gradient amplification during directional sensing.

Bouzigues, Cedric ; Holcman, David ; Dahan, Maxime ; Bouzigues, Cedric (correspondence author) ; Bouzigues, Cedric (record owner)

PloS one, February 22, 2010, Vol.5(2), p.e9243 [Revue évaluée par les pairs]

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15
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Narrow escape for a stochastically gated brownian ligand

Reingruber, Jürgen ; Holcman, David

Journal of Physics: Condensed Matter, 2010, Vol.22(6), p.065103 (12pp) [Revue évaluée par les pairs]

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Article
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Synapse geometry and receptor dynamics modulate synaptic strength

Dominik Freche ; Ulrike Pannasch ; Nathalie Rouach ; David Holcman

PLoS ONE, Vol.6(10), p.e25122 [Revue évaluée par les pairs]

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17
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Diffusion laws in dendritic spines

Holcman, David ; Schuss, Zeev

The Journal of Mathematical Neuroscience (JMN), 2011, Vol.1(1), pp.1-14 [Revue évaluée par les pairs]

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18
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Article
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Semi-classical limits of the first eigenfunction and concentration on the recurrent sets of a dynamical system

Holcman, David ; Kupka, Ivan

Forum Mathematicum, Jan 2011, Vol.23(1), pp.1-74 [Revue évaluée par les pairs]

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19
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Article
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Hybrid Markov-mass action law model for cell activation by rare binding events: Application to calcium induced vesicular release at neuronal synapses

Claire Guerrier ; David Holcman

Scientific Reports, 2016, Vol.6 [Revue évaluée par les pairs]

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20
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Article
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Transient chromatin properties revealed by polymer models and stochastic simulations constructed from Chromosomal Capture data.

Shukron, Ofir ; Holcman, David ; Shukron, Ofir (correspondence author) ; Shukron, Ofir (record owner)

PLoS computational biology, April 2017, Vol.13(4), p.e1005469 [Revue évaluée par les pairs]

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Auteur 

  1. Rouach, Nathalie  (7)
  2. Kupka, Ivan  (5)
  3. Giaume, Christian  (4)
  4. Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) ( IBENS ) ; Département de Biologie - ENS Paris ; École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )  (4)
  5. Reingruber, Jürgen  (4)
  6. Dao Duc, Khanh  (4)
  7. Guerrier, Claire  (3)
  8. Sieben, Christian  (3)
  9. Herrmann, Andreas  (3)
  10. Shukron, Ofir  (3)
  11. Pannasch, Ulrike  (3)
  12. Rouach , Nathalie  (3)
  13. Segal, Menahem  (2)
  14. Centre interdisciplinaire de recherche en biologie ( CIRB ) ; Collège de France ( CdF ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )  (2)
  15. Ezan , Pascal  (2)
  16. Amitai, Assaf  (2)
  17. Lagache, Thibault  (2)
  18. Institut de biologie de l'Ecole Normale Supérieure ( IBENS ) ; École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )  (2)
  19. Korkotian, Eduard  (2)
  20. Parutto, Pierre  (2)
  21. Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 )  (1)
  22. Institut des Neurosciences de Paris-Saclay ( Neuro-PSI ) ; Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )  (1)
  23. Petkovic , Maja  (1)
  24. PSL Research University  (1)
  25. Institut Jacques Monod ( IJM ) ; Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )  (1)
  26. Paris Sciences et Lettres  (1)
  27. Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Agence Nationale de la Recherche, High Council for Scientific and Technological Cooperation, Ministere de la Recherche et de la Technologie, France, Association Francaise contre les Myopathies, Human Frontier Science Program, European Research Council, Ecole des Neurosciences de Paris (Paris School of Neuroscience)  (1)
  28. Vert, Jean-Philippe (1973-...)  (1)
  29. École doctorale de Sciences mathématiques de Paris Centre, Paris  (1)
  30. Laboratoire de Probabilités et Modèles Aléatoires ( LPMA ) ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )  (1)
  31. Reingruber , Jurgen  (1)
  32. Vargova , Lydia  (1)
  33. Guerrier , Claire  (1)
  34. Tsodyks, Misha  (1)
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  1. Holcman, David
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  5. Holcman , David

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